Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf3Q60980 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms