Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp4Q60972 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms