Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Meis1Q60954 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Meis1Q60954 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms