Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Neurod1Q60867 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Neurod1Q60867 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Neurod1Q60867 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Neurod1Q60867 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Neurod1Q60867 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Neurod1Q60867 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Neurod1Q60867 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Neurod1Q60867 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Neurod1Q60867 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Neurod1Q60867 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Neurod1Q60867 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Neurod1Q60867 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Neurod1Q60867 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Neurod1Q60867 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Neurod1Q60867 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Neurod1Q60867 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Neurod1Q60867 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms