Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Epha1Q60750 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms