Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Samhd1Q60710 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Samhd1Q60710 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Samhd1Q60710 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Samhd1Q60710 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Samhd1Q60710 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Samhd1Q60710 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Samhd1Q60710 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Samhd1Q60710 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Samhd1Q60710 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Samhd1Q60710 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Samhd1Q60710 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Samhd1Q60710 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms