Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nr2f1Q60632 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms