Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFR0

Pabpn1l, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1lQ5XFR0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpn1lQ5XFR0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pabpn1lQ5XFR0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pabpn1lQ5XFR0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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