Protein–RNA interactions for Protein: Q5U430

Ubr3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr3Q5U430 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubr3Q5U430 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubr3Q5U430 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubr3Q5U430 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubr3Q5U430 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ubr3Q5U430 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ubr3Q5U430 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ubr3Q5U430 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ubr3Q5U430 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ubr3Q5U430 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ubr3Q5U430 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ubr3Q5U430 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ubr3Q5U430 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ubr3Q5U430 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ubr3Q5U430 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ubr3Q5U430 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ubr3Q5U430 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubr3Q5U430 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubr3Q5U430 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubr3Q5U430 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubr3Q5U430 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubr3Q5U430 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubr3Q5U430 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubr3Q5U430 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubr3Q5U430 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubr3Q5U430 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms