Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PfasQ5SUR0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PfasQ5SUR0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PfasQ5SUR0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PfasQ5SUR0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.5 ms