Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psme4Q5SSW2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Psme4Q5SSW2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Psme4Q5SSW2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psme4Q5SSW2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Psme4Q5SSW2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Psme4Q5SSW2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Psme4Q5SSW2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Psme4Q5SSW2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Psme4Q5SSW2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Psme4Q5SSW2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Psme4Q5SSW2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Psme4Q5SSW2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Psme4Q5SSW2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Psme4Q5SSW2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Psme4Q5SSW2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Psme4Q5SSW2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Psme4Q5SSW2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Psme4Q5SSW2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Psme4Q5SSW2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Psme4Q5SSW2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Psme4Q5SSW2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Psme4Q5SSW2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Psme4Q5SSW2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Psme4Q5SSW2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms