Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sft2d1Q5SSN7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sft2d1Q5SSN7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms