Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930512M02RikQ5SQK8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms