Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim58Q5NCC9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim58Q5NCC9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim58Q5NCC9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim58Q5NCC9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim58Q5NCC9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim58Q5NCC9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim58Q5NCC9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim58Q5NCC9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim58Q5NCC9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim58Q5NCC9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim58Q5NCC9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim58Q5NCC9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim58Q5NCC9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim58Q5NCC9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim58Q5NCC9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim58Q5NCC9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim58Q5NCC9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim58Q5NCC9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim58Q5NCC9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim58Q5NCC9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Trim58Q5NCC9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim58Q5NCC9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim58Q5NCC9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim58Q5NCC9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim58Q5NCC9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim58Q5NCC9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim58Q5NCC9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim58Q5NCC9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim58Q5NCC9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim58Q5NCC9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim58Q5NCC9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim58Q5NCC9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim58Q5NCC9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim58Q5NCC9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim58Q5NCC9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim58Q5NCC9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim58Q5NCC9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim58Q5NCC9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim58Q5NCC9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim58Q5NCC9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim58Q5NCC9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim58Q5NCC9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms