Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SynaQ5G5D5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynaQ5G5D5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms