Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp13Q5BKP2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp13Q5BKP2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp13Q5BKP2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms