Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc84Q4VA36 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc84Q4VA36 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms