Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

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Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Herc2Q4U2R1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Herc2Q4U2R1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Herc2Q4U2R1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Herc2Q4U2R1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Herc2Q4U2R1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Herc2Q4U2R1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Herc2Q4U2R1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Herc2Q4U2R1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc2Q4U2R1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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