Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0K9

Snhg11, Small nucleolar RNA host gene 11, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snhg11Q4G0K9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snhg11Q4G0K9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snhg11Q4G0K9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snhg11Q4G0K9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snhg11Q4G0K9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snhg11Q4G0K9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snhg11Q4G0K9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms