Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syne3Q4FZC9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms