Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZRW6

Clul1, Clusterin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clul1Q3ZRW6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clul1Q3ZRW6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clul1Q3ZRW6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clul1Q3ZRW6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clul1Q3ZRW6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clul1Q3ZRW6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clul1Q3ZRW6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clul1Q3ZRW6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clul1Q3ZRW6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clul1Q3ZRW6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clul1Q3ZRW6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clul1Q3ZRW6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Clul1Q3ZRW6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clul1Q3ZRW6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clul1Q3ZRW6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clul1Q3ZRW6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Clul1Q3ZRW6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clul1Q3ZRW6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clul1Q3ZRW6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clul1Q3ZRW6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clul1Q3ZRW6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clul1Q3ZRW6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clul1Q3ZRW6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clul1Q3ZRW6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clul1Q3ZRW6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clul1Q3ZRW6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clul1Q3ZRW6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clul1Q3ZRW6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clul1Q3ZRW6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clul1Q3ZRW6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clul1Q3ZRW6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clul1Q3ZRW6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clul1Q3ZRW6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clul1Q3ZRW6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clul1Q3ZRW6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clul1Q3ZRW6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Clul1Q3ZRW6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clul1Q3ZRW6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clul1Q3ZRW6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Clul1Q3ZRW6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clul1Q3ZRW6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clul1Q3ZRW6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms