Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd5Q3V1H9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd5Q3V1H9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samd5Q3V1H9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd5Q3V1H9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms