Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ckap2Q3V1H1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ckap2Q3V1H1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ckap2Q3V1H1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ckap2Q3V1H1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ckap2Q3V1H1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ckap2Q3V1H1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ckap2Q3V1H1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ckap2Q3V1H1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ckap2Q3V1H1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ckap2Q3V1H1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ckap2Q3V1H1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ckap2Q3V1H1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ckap2Q3V1H1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ckap2Q3V1H1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ckap2Q3V1H1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ckap2Q3V1H1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ckap2Q3V1H1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ckap2Q3V1H1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ckap2Q3V1H1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ckap2Q3V1H1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ckap2Q3V1H1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ckap2Q3V1H1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ckap2Q3V1H1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms