Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ulk4Q3V129 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ulk4Q3V129 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ulk4Q3V129 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ulk4Q3V129 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ulk4Q3V129 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ulk4Q3V129 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ulk4Q3V129 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ulk4Q3V129 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ulk4Q3V129 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ulk4Q3V129 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ulk4Q3V129 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ulk4Q3V129 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ulk4Q3V129 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ulk4Q3V129 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ulk4Q3V129 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ulk4Q3V129 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ulk4Q3V129 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ulk4Q3V129 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ulk4Q3V129 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ulk4Q3V129 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ulk4Q3V129 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ulk4Q3V129 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ulk4Q3V129 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ulk4Q3V129 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ulk4Q3V129 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ulk4Q3V129 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ulk4Q3V129 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ulk4Q3V129 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ulk4Q3V129 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ulk4Q3V129 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ulk4Q3V129 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ulk4Q3V129 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ulk4Q3V129 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ulk4Q3V129 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ulk4Q3V129 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ulk4Q3V129 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ulk4Q3V129 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ulk4Q3V129 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ulk4Q3V129 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ulk4Q3V129 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ulk4Q3V129 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ulk4Q3V129 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ulk4Q3V129 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ulk4Q3V129 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ulk4Q3V129 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.5 ms