Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc27Q3V036 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc27Q3V036 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms