Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed1Q3V009 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed1Q3V009 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tmed1Q3V009 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed1Q3V009 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed1Q3V009 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed1Q3V009 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed1Q3V009 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed1Q3V009 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed1Q3V009 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed1Q3V009 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed1Q3V009 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmed1Q3V009 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmed1Q3V009 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmed1Q3V009 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmed1Q3V009 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed1Q3V009 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed1Q3V009 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed1Q3V009 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed1Q3V009 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed1Q3V009 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.4 ms