Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrfip1Q3UZ39 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrfip1Q3UZ39 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms