Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3l2Q3UXB0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms