Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc114Q3UX62 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc114Q3UX62 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc114Q3UX62 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc114Q3UX62 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc114Q3UX62 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc114Q3UX62 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc114Q3UX62 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc114Q3UX62 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc114Q3UX62 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc114Q3UX62 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc114Q3UX62 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc114Q3UX62 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc114Q3UX62 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc114Q3UX62 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc114Q3UX62 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc114Q3UX62 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc114Q3UX62 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.8 ms