Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWZ0

Trim75, Tripartite motif-containing protein 75, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim75Q3UWZ0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim75Q3UWZ0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim75Q3UWZ0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim75Q3UWZ0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim75Q3UWZ0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim75Q3UWZ0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim75Q3UWZ0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim75Q3UWZ0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim75Q3UWZ0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trim75Q3UWZ0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim75Q3UWZ0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim75Q3UWZ0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim75Q3UWZ0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms