Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT80

Gm1587, Predicted gene 1587, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1587Q3UT80 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm1587Q3UT80 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm1587Q3UT80 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm1587Q3UT80 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm1587Q3UT80 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm1587Q3UT80 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm1587Q3UT80 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms