Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BB287469Q3UT53 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BB287469Q3UT53 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BB287469Q3UT53 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.4 ms