Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
B230104I21RikQ3USW4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
B230104I21RikQ3USW4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
B230104I21RikQ3USW4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B230104I21RikQ3USW4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B230104I21RikQ3USW4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B230104I21RikQ3USW4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
B230104I21RikQ3USW4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
B230104I21RikQ3USW4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
B230104I21RikQ3USW4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
B230104I21RikQ3USW4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
B230104I21RikQ3USW4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B230104I21RikQ3USW4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B230104I21RikQ3USW4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B230104I21RikQ3USW4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
B230104I21RikQ3USW4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B230104I21RikQ3USW4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
B230104I21RikQ3USW4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
B230104I21RikQ3USW4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
B230104I21RikQ3USW4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
B230104I21RikQ3USW4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms