Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdgfl2Q3UMU9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdgfl2Q3UMU9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms