Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cog7Q3UM29 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cog7Q3UM29 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cog7Q3UM29 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cog7Q3UM29 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cog7Q3UM29 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cog7Q3UM29 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cog7Q3UM29 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cog7Q3UM29 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cog7Q3UM29 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cog7Q3UM29 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cog7Q3UM29 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cog7Q3UM29 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cog7Q3UM29 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms