Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BtrcQ3ULA2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BtrcQ3ULA2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BtrcQ3ULA2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BtrcQ3ULA2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BtrcQ3ULA2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BtrcQ3ULA2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BtrcQ3ULA2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BtrcQ3ULA2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BtrcQ3ULA2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BtrcQ3ULA2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BtrcQ3ULA2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BtrcQ3ULA2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BtrcQ3ULA2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms