Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam83fQ3UKU4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fam83fQ3UKU4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam83fQ3UKU4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam83fQ3UKU4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam83fQ3UKU4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam83fQ3UKU4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam83fQ3UKU4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam83fQ3UKU4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam83fQ3UKU4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam83fQ3UKU4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam83fQ3UKU4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam83fQ3UKU4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms