Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcgf5Q3UK78 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pcgf5Q3UK78 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcgf5Q3UK78 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcgf5Q3UK78 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms