Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc61Q3UJV1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc61Q3UJV1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc61Q3UJV1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms