Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHN9

Ndst1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst1Q3UHN9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndst1Q3UHN9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndst1Q3UHN9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms