Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Greb1Q3UHK3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Greb1Q3UHK3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Greb1Q3UHK3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Greb1Q3UHK3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Greb1Q3UHK3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Greb1Q3UHK3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms