Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LchnQ3UHG7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LchnQ3UHG7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms