Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mier3Q3UHF3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mier3Q3UHF3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mier3Q3UHF3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mier3Q3UHF3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mier3Q3UHF3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mier3Q3UHF3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mier3Q3UHF3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mier3Q3UHF3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Mier3Q3UHF3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mier3Q3UHF3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mier3Q3UHF3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mier3Q3UHF3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mier3Q3UHF3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mier3Q3UHF3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mier3Q3UHF3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mier3Q3UHF3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mier3Q3UHF3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mier3Q3UHF3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mier3Q3UHF3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mier3Q3UHF3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mier3Q3UHF3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mier3Q3UHF3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mier3Q3UHF3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mier3Q3UHF3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms