Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef3Q3UGY8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfgef3Q3UGY8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Arfgef3Q3UGY8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Arfgef3Q3UGY8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms