Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc58Q3UGP9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc58Q3UGP9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc58Q3UGP9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms