Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Yipf3Q3UDR8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yipf3Q3UDR8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms