Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U595 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U595 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U595 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U595 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U595 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U595 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U595 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U595 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U595 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U595 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U595 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U595 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U595 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U595 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q3U595 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U595 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U595 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U595 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U595 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U595 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U595 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U595 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U595 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U595 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U595 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U595 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U595 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U595 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U595 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U595 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U595 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U595 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U595 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U595 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U595 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U595 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U595 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U595 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U595 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U595 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U595 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U595 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U595 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U595 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U595 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U595 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U595 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U595 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U595 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U595 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U595 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U595 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U595 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U595 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U595 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U595 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U595 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U595 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U595 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U595 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U595 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3U595 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3U595 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3U595 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3U595 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3U595 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3U595 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3U595 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3U595 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U595 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U595 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U595 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U595 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U595 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U595 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U595 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U595 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U595 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U595 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U595 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3U595 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3U595 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3U595 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3U595 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3U595 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3U595 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3U595 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3U595 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U595 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U595 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U595 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U595 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U595 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U595 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U595 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U595 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U595 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U595 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U595 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms