Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hvcn1Q3U2S8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hvcn1Q3U2S8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hvcn1Q3U2S8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hvcn1Q3U2S8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hvcn1Q3U2S8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hvcn1Q3U2S8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hvcn1Q3U2S8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hvcn1Q3U2S8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hvcn1Q3U2S8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hvcn1Q3U2S8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hvcn1Q3U2S8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hvcn1Q3U2S8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hvcn1Q3U2S8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hvcn1Q3U2S8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hvcn1Q3U2S8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hvcn1Q3U2S8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hvcn1Q3U2S8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hvcn1Q3U2S8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hvcn1Q3U2S8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hvcn1Q3U2S8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hvcn1Q3U2S8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hvcn1Q3U2S8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hvcn1Q3U2S8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hvcn1Q3U2S8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hvcn1Q3U2S8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hvcn1Q3U2S8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hvcn1Q3U2S8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hvcn1Q3U2S8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hvcn1Q3U2S8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hvcn1Q3U2S8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hvcn1Q3U2S8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms