Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc174Q3U155 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc174Q3U155 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc174Q3U155 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms