Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc127Q3TC33 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc127Q3TC33 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms